濃飛バスは昭和２３年（1948年）より乗鞍へのシャトルバスを運行しています。
乗鞍への登山道路（現在の乗鞍スカイライン）は、旧陸軍が高度に対応できる航空機エンジンを開発する試験場を建設するための軍用道路として計画されました。軍はトラックが通れる幅員３ｍで建設を計画していましたが、濃飛バスの初代社長上嶋清一は、戦争が終わったあとに観光道路へ転用することを考え、総工費42万円のうち個人私財8万円（現在の貨幣価値にして約4億円）を負担することで陸軍を承諾させ、バスの運行許可が下りる3.6mで建設することになりました。

道路は昭和16年（1941年）に着工し難工事の末昭和17年（1942年）秋に開通しましたが、その数年後に終戦を迎え実際に軍用道路として使われることはありませんでした。その後、昭和２３年（1948年）７月に乗鞍への路線バスの試運転を行い、日本初の天井全面ガラス貼りの車両「ロマンスカー」が使用されました。この車両は車内から乗鞍の絶景を３６０度楽しめるようにと特別に開発した車両で、車内から見える景色は抜群でしたが、その当時のバスには冷房の設備がなく、乗車すると夏の直射日光が天井からさんさんと降り注ぎ、乗客から暑いと評判が悪かったため、残念ながら数年で姿を消しました。

開通当時の乗鞍への登山道路は大変狭く土道で、道路上には石がゴロゴロと転がっており、車掌が降りて石を除けながら運行することや、ヘアピンカーブでバスが重くて登りきれない時、お客様に押していただく事もあったようです。

昭和２５年（1950年）８月に天皇陛下が皇太子の頃、乗鞍への登山バスにご乗車になられたニュースがメディアで大きく取り上げられ乗鞍岳の名が全国に知れ渡りました。また、毎日新聞主催「新日本観光地百選」の山岳の部において、乗鞍岳が４位に入選し登山バスの利用者の増大につながりました。

昭和３４年（1959年）には、運行日数が５６日で１１６千人の方にご利用いただいた記録が残っています。しかし、昭和４０年代に入り、マイカーが急激に普及し登山バスの利用者は徐々に減少、代わってマイカーの利用台数が増えていきます。昭和４２年（1967年）のピーク日には５，６００台のマイカーが利用した事もあったようです。
その後、県道乗鞍公園線の大幅改良が行われ、昭和４８年（1973年）に山岳有料道路「乗鞍スカイライン」が完成。３０年間の有料道路としての運用を経たあと、平成15年（2003年）より道路の渋滞解消と自然環境を保護するためマイカー規制を行い、現在ではバスやタクシー・自転車だけが通行できる道路となりました。